19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4021 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  32.75 
 
 		 443 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  32.75 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  31.98 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  31.36 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  31.87 
 
 		 305 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  38.27 
 
 		 382 aa  65.1  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  29.24 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  39.76 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  32.2 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  34.44 
 
 		 317 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  32.93 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  28.4 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49380  hypothetical protein  26.83 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  48.84 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  31.67 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>