16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4829 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  554  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  94.6 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  94.24 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  82.08 
 
 		 279 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  62.11 
 
 		 443 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  61.4 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  59.65 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49380  hypothetical protein  62.18 
 
 		 165 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  34.27 
 
 		 224 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  37.18 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  37.18 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  37.65 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  32.56 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  36.11 
 
 		 268 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>