37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5055 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  38.98 
 
 
302 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  36.8 
 
 
313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  35.71 
 
 
317 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  39.17 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1999  hypothetical protein  43 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  34.78 
 
 
443 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  34.06 
 
 
388 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  46.67 
 
 
975 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  34.25 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  30.11 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  38.61 
 
 
3787 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  31.51 
 
 
329 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  30.37 
 
 
347 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  48.08 
 
 
238 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  39.73 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  41.56 
 
 
2472 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  42.65 
 
 
760 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  43.48 
 
 
3166 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  31.51 
 
 
278 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  31.07 
 
 
305 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4569  hypothetical protein  15.28 
 
 
495 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0942693  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  51.85 
 
 
1457 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  34.18 
 
 
2196 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  35.4 
 
 
647 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  43.33 
 
 
2532 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  45.71 
 
 
645 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  32.18 
 
 
119 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  47.06 
 
 
551 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2207  hypothetical protein  34.83 
 
 
350 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395181  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  40.91 
 
 
582 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  44.29 
 
 
3295 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1484  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  38.1 
 
 
1116 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1569  ribonuclease E  43.18 
 
 
1216 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000219809  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1677  ribonuclease E  43.18 
 
 
1216 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000377607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>