21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0155 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0155  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  813    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  43.1 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0586  hypothetical protein  42.5 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.777226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  39.34 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  39.42 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30685  predicted protein  28.17 
 
 		 1362 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.761238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  41.94 
 
 		 479 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  17.91 
 
 		 657 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  21.62 
 
 		 1311 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0139  hypothetical protein  51.79 
 
 		 350 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0903001  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  21.62 
 
 		 1311 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  27.68 
 
 		 794 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2328  hypothetical protein  23.7 
 
 		 112 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.54693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 749 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0178  hypothetical protein  34.29 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000132954  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  40.91 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  21 
 
 		 357 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  34.07 
 
 		 469 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66478  predicted protein  24.63 
 
 		 1562 aa  43.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  25.38 
 
 		 754 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>