More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4263 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4263  transcription elongation factor GreA/GreB  100 
 
 		 165 aa  333  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4601  transcription elongation factor GreB  89.02 
 
 		 165 aa  295  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4873  GreA/GreB family elongation factor  72.84 
 
 		 164 aa  236  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.772503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4508  GreA/GreB family elongation factor  67.7 
 
 		 165 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0708  GreA/GreB family elongation factor  66.67 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0676  GreA/GreB family elongation factor  65.84 
 
 		 165 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0707  GreA/GreB family elongation factor  65.22 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.975764  normal  0.0706669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0401  transcription elongation factor, putative  45.78 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1137  GreA/GreB family elongation factor  42.33 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5139  transcription elongation factor regulatory protein  38.04 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276669  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2845  GreA/GreB family elongation factor  38.36 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4333  GreA/GreB family elongation factor  42.07 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  0.881109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2119  GreA/GreB family elongation factor  35.58 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702763  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1838  GreA/GreB family elongation factor  34.97 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3876  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  40 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131848  normal  0.0366089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1756  GreA/GreB family elongation factor  34.36 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0865  transcription elongation factor GreB  32.96 
 
 		 186 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494541  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5114  transcription elongation factor regulatory protein  37.35 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2366  GreA/GreB family elongation factor  37.74 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.805703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0950  transcription elongation factor GreB  32.4 
 
 		 186 aa  91.3  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380314  hitchhiker  0.0000173092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4186  GreA/GreB family elongation factor  39.31 
 
 		 154 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2930  transcription elongation factor regulatory protein  36.02 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0721  GreA/GreB family elongation factor  38.12 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.44423  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2011  putative transcription elongation factor  38.12 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1165  transcription elongation factor regulatory protein  39.02 
 
 		 160 aa  87.8  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0731  GreA/GreB family elongation factor  38.61 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000249638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2023  transcription elongation factor GreB  30.68 
 
 		 188 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1201  transcription elongation factor GreB  34 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0727535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0718  GreA/GreB family elongation factor  37.62 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.188728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1370  transcription elongation factor GreB  33.52 
 
 		 184 aa  84.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3586  transcription elongation factor GreB  30.94 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687664  hitchhiker  0.00676969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3833  GreA/GreB family elongation factor  37.58 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0395  transcription elongation factor GreB  45.37 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0662581  normal  0.0531871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2668  transcription elongation factor GreB  39.22 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049462  normal  0.0488826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0520  transcription elongation factor GreB  40.59 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.525146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0323  transcription elongation factor GreB  40.78 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.276985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1103  GreA/GreB family elongation factor  32.68 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000308289  normal  0.0184015 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3408  GreA/GreB family elongation factor  37.65 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1871  transcription elongation factor GreB  30.94 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2470  transcription elongation factor GreB  29.78 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0253654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2146  transcription elongation factor regulatory protein  34.76 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6110  transcription elongation factor GreB  33.55 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1652  GreA/GreB family elongation factor  31.93 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1105  GreA/GreB family elongation factor  31.74 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.340307  normal  0.981817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1741  transcription elongation factor regulatory protein  33.54 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2863  transcription elongation factor GreB  40.78 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0732  transcription elongation factor GreB  29.05 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3202  transcription elongation factor regulatory protein  36.05 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4357  transcription elongation factor regulatory protein  35.15 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1753  GreA/GreB family elongation factor  31.61 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1778  transcription elongation factor GreB  33.33 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1733  transcription elongation factor GreB  43.69 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0896689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2152  transcription elongation factor GreB  28.89 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000119957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1126  transcription elongation factor GreB  30.51 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.19101e-20  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1441  GreA/GreB family elongation factor  35.92 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0859  transcription elongation factor GreB  28.65 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4332  transcription elongation factor GreB  29.19 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.313941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2390  transcription elongation factor regulatory protein  32.93 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0124543  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1950  transcription elongation factor GreB  28.73 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697488  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2677  GreA/GreB family elongation factor  38.83 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2723  transcription elongation factor  29.94 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3981  transcription elongation factor GreB  33.33 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2273  transcription elongation factor GreB  28.73 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0171  transcription elongation factor GreB  33.33 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2707  GreA/GreB family elongation factor  34.69 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1332  GreA/GreB family elongation factor  37.27 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.294175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3150  GreA/GreB family elongation factor  37.27 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4017  transcription elongation factor GreB  38.83 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11479  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0808  transcription elongation factor GreB  36.54 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0673  transcription elongation factor GreB  30.56 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0253655  normal  0.983843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1580  transcription elongation factor regulatory protein  33.54 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0460715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1206  GreA/GreB family elongation factor  36.55 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3307  transcription elongation factor GreB  31.54 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000320561  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0165  transcription elongation factor GreB  27.62 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0862  transcription elongation factor GreB  28.81 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000987565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0874  transcription elongation factor GreB  28.81 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0745968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2561  transcription elongation factor GreB  35.92 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.01679  hitchhiker  0.00000000000012211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2396  transcription elongation factor GreB  36.63 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4110  transcription elongation factor GreB  35.64 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000102094  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1494  transcription elongation factor GreB  31.29 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  34.31 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0339  GreA/GreB family elongation factor  30.54 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2091  transcription elongation factor GreB  35.45 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3010  transcription elongation factor GreB  35.45 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.998685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0820  transcription elongation factor GreB  35.45 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2944  transcription elongation factor GreB  35.45 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1959  transcription elongation factor GreB  35.45 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51931  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1784  transcription elongation factor GreA  29.73 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.867694  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2653  transcription elongation factor GreB  35.45 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0303907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3044  transcription elongation factor GreB  35.64 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00484653  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  34.31 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3777  transcription elongation factor GreB  36.46 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  34.31 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0962  transcription elongation factor GreB  35.64 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00012209  normal  0.571045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27130  transcription elongation factor GreB  32.67 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1002  transcription elongation factor GreB  35.64 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0052225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>