More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1112 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.86 
 
 		 484 aa  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  97.15 
 
 		 468 aa  901    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  72.94 
 
 		 473 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.44 
 
 		 479 aa  676    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  100 
 
 		 483 aa  976    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  84.45 
 
 		 475 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.78 
 
 		 484 aa  704    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.65 
 
 		 484 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.99 
 
 		 484 aa  704    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  72.03 
 
 		 482 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  45.47 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001060  signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 488 aa  353  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  47.58 
 
 		 396 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 443 aa  213  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 717 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 535 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  40.07 
 
 		 454 aa  193  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  38.49 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 443 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 330 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 493 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 469 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  36.5 
 
 		 276 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  38.7 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  32.16 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  34.21 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 469 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  34.69 
 
 		 474 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  41.41 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  40.13 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  30.75 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  35.48 
 
 		 344 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 435 aa  164  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  33.63 
 
 		 444 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 442 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  34.89 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 428 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  32.48 
 
 		 425 aa  160  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 425 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  32.48 
 
 		 425 aa  160  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  39.34 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  35.96 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 477 aa  156  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 438 aa  156  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  32.41 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  38.24 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  34.1 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  34.29 
 
 		 270 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>