More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0113 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0113  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  100 
 
 		 664 aa  1358    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0116  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  65.61 
 
 		 664 aa  865    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0088  oligopeptidase A  33.58 
 
 		 680 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  32.79 
 
 		 681 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  32.2 
 
 		 681 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  32.25 
 
 		 692 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  30.92 
 
 		 682 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  32.25 
 
 		 695 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  31.95 
 
 		 695 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  31.95 
 
 		 695 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  31.8 
 
 		 683 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  31.03 
 
 		 683 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  31.18 
 
 		 683 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 681 aa  276  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  28.21 
 
 		 676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  29.3 
 
 		 683 aa  249  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  30.22 
 
 		 677 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  29.22 
 
 		 694 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  28.53 
 
 		 679 aa  244  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  27.78 
 
 		 680 aa  243  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  27.78 
 
 		 680 aa  243  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  27.78 
 
 		 680 aa  243  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  27.78 
 
 		 680 aa  243  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  27.78 
 
 		 680 aa  243  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  27.37 
 
 		 680 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  27.78 
 
 		 680 aa  243  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  27.78 
 
 		 680 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  27.51 
 
 		 678 aa  242  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  27.78 
 
 		 680 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  27.78 
 
 		 680 aa  242  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  27.59 
 
 		 680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3984  oligopeptidase A  29.1 
 
 		 682 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199844  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1923  oligopeptidase A  29.36 
 
 		 679 aa  240  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0492523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  27.5 
 
 		 680 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  28.08 
 
 		 680 aa  239  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  28.18 
 
 		 686 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  28.24 
 
 		 679 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  28.03 
 
 		 680 aa  237  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  27.47 
 
 		 680 aa  236  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  26.72 
 
 		 680 aa  236  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  27.3 
 
 		 680 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  27.3 
 
 		 680 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  27.3 
 
 		 680 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  29.15 
 
 		 682 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  27.95 
 
 		 679 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  27.15 
 
 		 680 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  27.95 
 
 		 679 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  27.99 
 
 		 680 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2458  oligopeptidase A  29.18 
 
 		 679 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  28.53 
 
 		 685 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  30.58 
 
 		 712 aa  233  8.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  27.63 
 
 		 679 aa  233  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  27.01 
 
 		 680 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  27.8 
 
 		 679 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  26.09 
 
 		 685 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  25.94 
 
 		 683 aa  231  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  29.83 
 
 		 676 aa  230  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  28.7 
 
 		 683 aa  230  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  27.91 
 
 		 678 aa  230  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  27.79 
 
 		 680 aa  230  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  27.19 
 
 		 679 aa  230  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  27.79 
 
 		 680 aa  230  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  26.71 
 
 		 679 aa  229  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  28.3 
 
 		 682 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2614  oligopeptidase A  27.98 
 
 		 685 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  27.05 
 
 		 680 aa  227  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  27.64 
 
 		 682 aa  228  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  26.13 
 
 		 695 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  27.33 
 
 		 681 aa  225  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2158  Oligopeptidase A  30.22 
 
 		 685 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  28.76 
 
 		 716 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  28.45 
 
 		 679 aa  223  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2129  oligopeptidase A  28.97 
 
 		 677 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1653  Oligopeptidase A  28.97 
 
 		 677 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  28.41 
 
 		 704 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  27.19 
 
 		 679 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  26.68 
 
 		 679 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  27.19 
 
 		 679 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2208  oligopeptidase A  28.84 
 
 		 679 aa  221  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696851  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0084  oligopeptidase A  31.39 
 
 		 731 aa  220  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.611624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  26.89 
 
 		 679 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  24.93 
 
 		 679 aa  218  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  27.46 
 
 		 679 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  29.45 
 
 		 695 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  27.19 
 
 		 679 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  26.51 
 
 		 683 aa  217  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  27.15 
 
 		 680 aa  217  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  28.55 
 
 		 700 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2855  oligopeptidase A  28.1 
 
 		 687 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  27.73 
 
 		 679 aa  216  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  29.85 
 
 		 702 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  27.3 
 
 		 679 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  26.81 
 
 		 709 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  28.84 
 
 		 699 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0078  oligopeptidase A  31.14 
 
 		 741 aa  214  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  28.32 
 
 		 679 aa  213  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  28.84 
 
 		 699 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  28.84 
 
 		 699 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  28.84 
 
 		 699 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  29.34 
 
 		 685 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>