More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2579 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 431 aa  883    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  48.46 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  45.77 
 
 		 427 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 422 aa  289  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  41.71 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5161  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 651 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.45475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4632  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2086  oxidoreductase, FAD-binding  43.34 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133623  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0774  oxidoreductase, FAD-binding  43.34 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0572  oxidoreductase, FAD-binding  43.34 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0464061  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0501  oxidoreductase, FAD-binding  43.34 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1637  oxidoreductase, FAD-binding  43.34 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0684  oxidoreductase, FAD-binding  43.34 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1990  oxidoreductase, FAD-binding  43.34 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5272  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3095  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  42.37 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4996  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 		 422 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  38.78 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  38.78 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  38.78 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  38.27 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  35.99 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 		 430 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3822  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 487 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1329  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4460  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131027  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1662  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 486 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.739475  normal  0.281341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1479  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 423 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  37.19 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  34.95 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 449 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5539  putative FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 476 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300713  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  34.69 
 
 		 427 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1098  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  35.22 
 
 		 468 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  35.22 
 
 		 468 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  36.59 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  33.67 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  34.99 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 425 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 428 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 429 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  34.99 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  33.25 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.66 
 
 		 439 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 428 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 434 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  34.25 
 
 		 437 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  34.41 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 426 aa  206  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.25 
 
 		 426 aa  206  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  33.25 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  33.25 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.25 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.25 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.25 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>