182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1887 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  100 
 
 		 328 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  56.81 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  30.07 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.07 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  33.89 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  30.87 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  30.67 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  30.35 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  30.64 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  29.93 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  29.2 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.12 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  28.53 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  28.53 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.88 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.53 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  27.71 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.21 
 
 		 331 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.75 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.05 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.44 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.48 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.6 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.96 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.33 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.9 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.47 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.07 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.94 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.16 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.72 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.32 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.96 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  25.48 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  24.92 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.32 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.46 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.07 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.1 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.15 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  30.33 
 
 		 400 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.84 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  28.62 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.41 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  29.71 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  24.68 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.68 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  24.43 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  26.71 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.03 
 
 		 364 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  25.96 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  24.77 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.03 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.71 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.71 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.16 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  24.38 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.23 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.63 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.89 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  28.4 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  26.92 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.81 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  26.96 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  24.76 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  23.34 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  24.33 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  24.45 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  24.05 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.4 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  28.86 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  28.86 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  28.86 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  23.93 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.67 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.02 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  26.48 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  25 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  26.09 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  34.19 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  26.49 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  27.67 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  25.53 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  26.49 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  26.49 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  40.91 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  27.42 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  27.42 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1422  ATPase  24.1 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  26 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  25.95 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  27.36 
 
 		 4844 aa  62.8  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  29.11 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  39.77 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.02 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  26.36 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.76 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  37.5 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  28.02 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  26.01 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>