232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2458 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  100 
 
 
273 aa  541  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  82.84 
 
 
282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  82.84 
 
 
282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  82.84 
 
 
282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  79.34 
 
 
273 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  66.54 
 
 
283 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  66.54 
 
 
283 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  66.54 
 
 
283 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  65.04 
 
 
282 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  56.77 
 
 
280 aa  318  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.75 
 
 
286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  57.14 
 
 
268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.39 
 
 
271 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  56.39 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  56.25 
 
 
267 aa  301  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  55.47 
 
 
270 aa  300  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  59.22 
 
 
266 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  55.06 
 
 
284 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  60.78 
 
 
270 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  57.2 
 
 
265 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  57.54 
 
 
267 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  56.4 
 
 
265 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  56.4 
 
 
265 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.14 
 
 
267 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  56.35 
 
 
267 aa  296  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  55.3 
 
 
275 aa  295  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  59.09 
 
 
266 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  56.13 
 
 
260 aa  292  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  56.03 
 
 
267 aa  292  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  55.13 
 
 
271 aa  291  6e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  56.92 
 
 
268 aa  290  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  55.43 
 
 
265 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  54.72 
 
 
268 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  55.82 
 
 
267 aa  289  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.82 
 
 
267 aa  289  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  55.64 
 
 
267 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  56.35 
 
 
285 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  56.42 
 
 
279 aa  288  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  49.81 
 
 
285 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  53.73 
 
 
268 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.12 
 
 
271 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  53.79 
 
 
270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  59.35 
 
 
268 aa  286  4e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  55.43 
 
 
268 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.91 
 
 
286 aa  285  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  57.09 
 
 
269 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.69 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  56.13 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  57.65 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  51.57 
 
 
266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  57.94 
 
 
272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.37 
 
 
266 aa  281  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  54.55 
 
 
278 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  54.15 
 
 
307 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.72 
 
 
267 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  54.72 
 
 
267 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  53.18 
 
 
270 aa  278  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  54.37 
 
 
270 aa  278  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  54.09 
 
 
272 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  52.24 
 
 
272 aa  278  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  52.24 
 
 
272 aa  278  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  56.3 
 
 
272 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  54.98 
 
 
260 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  53.97 
 
 
260 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  52.92 
 
 
267 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  57.32 
 
 
271 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  54.58 
 
 
260 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.94 
 
 
270 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  54.72 
 
 
269 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  52.76 
 
 
270 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  49.81 
 
 
270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  50.19 
 
 
270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  52.24 
 
 
260 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  51.42 
 
 
267 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  53.57 
 
 
280 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  51.74 
 
 
279 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  49.39 
 
 
266 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  49.6 
 
 
267 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  49.6 
 
 
267 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  49.21 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.49 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.56 
 
 
263 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.56 
 
 
263 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.68 
 
 
308 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.97 
 
 
278 aa  89  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6855  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.43 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00217466  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  27.05 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  27.62 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.17 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6734  ATPase  33.33 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140161  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.86 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  28.65 
 
 
4844 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.05 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.05 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  26.05 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.21 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  28.42 
 
 
4979 aa  77  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.05 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  26.05 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  26.05 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>