142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6855 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6855  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 430 aa  850    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00217466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4075  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.05 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00469462  normal  0.209954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6734  ATPase  62.6 
 
 		 385 aa  340  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140161  normal  0.0815898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  38.85 
 
 		 280 aa  90.5  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  31.36 
 
 		 264 aa  87.8  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  37.75 
 
 		 282 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  37.75 
 
 		 282 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  37.11 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  37.75 
 
 		 282 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  33.67 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  37.33 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  32.45 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  33.33 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  31.41 
 
 		 285 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  39.02 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  35.04 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  39.02 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  35.38 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  36.8 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.47 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  31.47 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  35.51 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  38.21 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  34.31 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  34.78 
 
 		 4917 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  32.67 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  32.08 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  33.58 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  36.23 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  39.02 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  34.29 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  33.33 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  34.06 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  34.06 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  38.21 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  38.21 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  33.58 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  29.61 
 
 		 4979 aa  72.4  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  38.21 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  36.88 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  33.33 
 
 		 267 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  31.12 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  35 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.58 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  35.71 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  37.67 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  37.67 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  31.12 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  34.06 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  38.3 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  32.61 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  32.61 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  35.51 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  33.87 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  34.29 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  34.06 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  34 
 
 		 270 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  35.62 
 
 		 275 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  35.97 
 
 		 270 aa  69.7  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  31.88 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  34.06 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.09 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  35.86 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  36.23 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  30.81 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  34.06 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  29.87 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  34.29 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.52 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  31.15 
 
 		 4844 aa  67  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.01 
 
 		 278 aa  67  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.88 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  30.67 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  30.67 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  30.67 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  30.67 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.84 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  28.48 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.34 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  32.61 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  30.51 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.48 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  34.06 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  32.37 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  36.07 
 
 		 269 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  31.88 
 
 		 277 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  30.2 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  34.06 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.59 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  36.05 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  32.19 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  36.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  36.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  36.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  36.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  36.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  36.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  36.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  36.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>