268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2319 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  71.54 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  70.24 
 
 		 260 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  69.84 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  67.7 
 
 		 260 aa  364  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  66.93 
 
 		 270 aa  359  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  67.59 
 
 		 271 aa  355  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.41 
 
 		 266 aa  352  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  68.46 
 
 		 277 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  62.79 
 
 		 285 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  60.47 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  60.47 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  63.49 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  60.85 
 
 		 270 aa  311  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  58.87 
 
 		 265 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.56 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  61.29 
 
 		 272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.64 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  61.45 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  59.66 
 
 		 272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  59.66 
 
 		 272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  59.66 
 
 		 268 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  56.64 
 
 		 276 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  57.87 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  58.06 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.24 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  55.34 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  57.68 
 
 		 267 aa  301  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  58.68 
 
 		 268 aa  301  9e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  60.48 
 
 		 270 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.12 
 
 		 286 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  53.28 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  58.06 
 
 		 270 aa  298  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  58.5 
 
 		 265 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  58.47 
 
 		 270 aa  298  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  58.5 
 
 		 265 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.69 
 
 		 267 aa  297  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  55.73 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  54.09 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  55.25 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  56.13 
 
 		 271 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  57.31 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.55 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  55.73 
 
 		 285 aa  292  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  52.96 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  53.7 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  57.31 
 
 		 283 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  54.55 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  57.31 
 
 		 283 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  57.74 
 
 		 268 aa  292  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  57.31 
 
 		 283 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  54.86 
 
 		 278 aa  291  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  57.02 
 
 		 266 aa  291  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  55.82 
 
 		 269 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  55.04 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  54.86 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  56.25 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.35 
 
 		 286 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  53.36 
 
 		 267 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  57.31 
 
 		 282 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  53.36 
 
 		 267 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  53.36 
 
 		 266 aa  288  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  55.47 
 
 		 265 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  55.92 
 
 		 273 aa  284  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  54.26 
 
 		 267 aa  284  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.26 
 
 		 267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  52.57 
 
 		 268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  56.05 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  54.03 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  55.92 
 
 		 282 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  55.92 
 
 		 282 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  55.92 
 
 		 282 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  54.81 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  52.24 
 
 		 273 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  47.19 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  46.56 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  47.84 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  47.84 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  46.96 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  47.45 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  31.86 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  31.05 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  31.05 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.53 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.17 
 
 		 278 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  32.03 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  30.71 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.71 
 
 		 307 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.33 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  29.96 
 
 		 313 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  28.38 
 
 		 346 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.68 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  27.88 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  30.38 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  29.95 
 
 		 4917 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  30.81 
 
 		 4844 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  29.96 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.79 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.63 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  26.63 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>