278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3134 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3134  ATPase  100 
 
 
280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  57.35 
 
 
267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  57.35 
 
 
267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  55.84 
 
 
279 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.76 
 
 
267 aa  334  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  55.84 
 
 
268 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  56.09 
 
 
267 aa  332  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.24 
 
 
267 aa  331  8e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  53.68 
 
 
267 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  53.7 
 
 
268 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  55.19 
 
 
266 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  55.4 
 
 
270 aa  325  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.41 
 
 
268 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  53.87 
 
 
267 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  53.31 
 
 
267 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  54.44 
 
 
268 aa  323  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  53.31 
 
 
267 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  53.87 
 
 
307 aa  322  5e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  53.14 
 
 
268 aa  320  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  57.43 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  54.24 
 
 
278 aa  319  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.06 
 
 
286 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.65 
 
 
267 aa  318  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  57.41 
 
 
273 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  53.76 
 
 
271 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  51.66 
 
 
285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  52.33 
 
 
272 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  52.55 
 
 
269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  52.33 
 
 
272 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.68 
 
 
286 aa  311  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  53.05 
 
 
273 aa  311  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  52.03 
 
 
272 aa  310  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  53.05 
 
 
265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  53.93 
 
 
282 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  53.93 
 
 
282 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  53.93 
 
 
282 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  51.65 
 
 
266 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  53.51 
 
 
283 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  53.51 
 
 
283 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  53.51 
 
 
283 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  51.47 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.41 
 
 
271 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  51.47 
 
 
266 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  53.41 
 
 
276 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  55.38 
 
 
282 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  53.05 
 
 
268 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  50.18 
 
 
275 aa  298  6e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  52.38 
 
 
270 aa  298  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  51.12 
 
 
284 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  50 
 
 
267 aa  291  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.62 
 
 
267 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  51.53 
 
 
271 aa  290  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  50.38 
 
 
270 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  50 
 
 
270 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  49.81 
 
 
270 aa  289  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  49.06 
 
 
270 aa  288  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  51.34 
 
 
272 aa  288  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  50.38 
 
 
270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.2 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  50.38 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  50.38 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.75 
 
 
270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  50.57 
 
 
285 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  47.37 
 
 
279 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.24 
 
 
266 aa  279  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  50.57 
 
 
260 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  49.62 
 
 
265 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  49.62 
 
 
265 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  49.25 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  49.21 
 
 
277 aa  270  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  48.11 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  46.15 
 
 
280 aa  268  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  47.88 
 
 
260 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  47.19 
 
 
260 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  48.85 
 
 
270 aa  259  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  46.27 
 
 
266 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  46.27 
 
 
267 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  50 
 
 
267 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  50 
 
 
267 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  50.46 
 
 
267 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  30.28 
 
 
263 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  30.28 
 
 
263 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  30.28 
 
 
263 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.59 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.72 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.31 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  26.79 
 
 
264 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  27.94 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.72 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.79 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  26.79 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  27.2 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  26.79 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.79 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.46 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.55 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  26.55 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  26.55 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  26.55 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  26.55 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>