96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1276 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.75 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1508  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  52.06 
 
 		 266 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.620723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.8 
 
 		 265 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  47.35 
 
 		 258 aa  221  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.21 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.267923  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.33 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2837  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.51 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3023  putative ferredoxin  40.75 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.25 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0526  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.82 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.521957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.97 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0053324  hitchhiker  0.000000742335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.57 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3762  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.82 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1101  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.35 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0415  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.82 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1416  iron-sulfur cluster-binding protein  42.71 
 
 		 99 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.584187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.59 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2177  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.56 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_631  2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.38 
 
 		 98 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0657  pyruvate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.38 
 
 		 98 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.254159  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0725  pyruvic-ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  40.54 
 
 		 86 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.976921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  20.4 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  52.17 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  37.35 
 
 		 826 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  45.1 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  45.83 
 
 		 431 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0309  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.11 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0347  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit H  37.65 
 
 		 148 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.573694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  39.39 
 
 		 426 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.65 
 
 		 148 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.191314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1487  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45 
 
 		 324 aa  46.2  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00133534  hitchhiker  0.0000000109439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.75 
 
 		 427 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  43.75 
 
 		 423 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.65 
 
 		 148 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  40 
 
 		 314 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  37.68 
 
 		 421 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.29 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  38.6 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  34.15 
 
 		 421 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.03 
 
 		 929 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  31.08 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1113  NIL domain protein  30.3 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.646686  normal  0.0231239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.18 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  35.53 
 
 		 122 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.85 
 
 		 1073 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  40.32 
 
 		 414 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  41.18 
 
 		 396 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  45.65 
 
 		 543 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  35 
 
 		 398 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0553  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  37.08 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.238228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0845  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.3 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  38.81 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0557  sulfite reductase, subunit C  44.26 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  44.9 
 
 		 619 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  32.93 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.63 
 
 		 455 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0344  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.94 
 
 		 924 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  47.06 
 
 		 416 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.31 
 
 		 334 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2979  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 		 65 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1833  ferredoxin 2  36.76 
 
 		 583 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00530052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.62 
 
 		 57 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  43.75 
 
 		 414 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  43.14 
 
 		 597 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17130  4Fe-4S protein  40 
 
 		 516 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.29858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1978  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  38.18 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.996407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  31.08 
 
 		 645 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1421  ferredoxin, 4Fe-4S  41.86 
 
 		 56 aa  42.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  31.08 
 
 		 645 aa  42.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.21 
 
 		 933 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 491 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1033  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  47.73 
 
 		 74 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1303200000000001e-18  hitchhiker  0.00000903571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  42.62 
 
 		 383 aa  42.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 		 624 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.43 
 
 		 369 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  44 
 
 		 413 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 56 aa  42.4  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  43.75 
 
 		 415 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0242  Coenzyme F420 hydrogenase  43.86 
 
 		 538 aa  42.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  33.82 
 
 		 653 aa  42.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 600 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.43 
 
 		 989 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  25.54 
 
 		 1190 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  37.5 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3802  putative sigma54 specific transcriptional regulator  37.93 
 
 		 759 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  38.78 
 
 		 598 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.68 
 
 		 331 aa  42  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  37.68 
 
 		 417 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  43.75 
 
 		 413 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>