173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0490 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
148 aa  293  5e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  97.97 
 
 
148 aa  289  8e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.191314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0347  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit H  97.3 
 
 
148 aa  286  8e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.573694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0558  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  85.81 
 
 
151 aa  259  6.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.23 
 
 
148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0476  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.76 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0220  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.169897  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.57 
 
 
432 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.62 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.145659  normal  0.822343 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.62 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  32.29 
 
 
379 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  30.07 
 
 
826 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  42.62 
 
 
322 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  42.62 
 
 
503 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.67 
 
 
541 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  25.98 
 
 
543 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.08 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.356069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.65 
 
 
264 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  38.33 
 
 
505 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  43.1 
 
 
307 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.58 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
589 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  40 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0910  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.22 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00418266  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  32.26 
 
 
503 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0310  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.29 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  40.38 
 
 
301 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01385  conserved ferredoxin-related protein  30.95 
 
 
633 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.16 
 
 
519 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3019  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.81 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 
828 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  33.9 
 
 
502 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  34.67 
 
 
483 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  41.27 
 
 
821 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 
229 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  41.27 
 
 
821 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
612 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36 
 
 
674 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
355 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.1 
 
 
265 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.44 
 
 
305 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  37.31 
 
 
508 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36 
 
 
674 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1487  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.14 
 
 
324 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00133534  hitchhiker  0.0000000109439 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  40 
 
 
502 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3612  NIL domain-containing protein  29.79 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0684282  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17450  glycyl-radical enzyme activator family protein  45.1 
 
 
311 aa  43.5  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.478583  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  41.82 
 
 
295 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  28.57 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0884  hydrogenase large subunit domain protein  38.81 
 
 
507 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.139599  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0411  Ferredoxin hydrogenase  38.57 
 
 
531 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0687694  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2129  iron-sulfur cluster binding protein  34.55 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0916  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  42.86 
 
 
306 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  43.64 
 
 
639 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 
368 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.29 
 
 
1116 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  40 
 
 
482 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.33 
 
 
543 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0452  hypothetical protein  31.88 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1518  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.33 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 
282 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.87 
 
 
542 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01643  predicted 4Fe-4S ferridoxin-type protein  38.6 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0323242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1968  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012714  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  39.44 
 
 
493 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1523  hypothetical protein  38.6 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00369582  hitchhiker  0.0000000711614 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 
357 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.51 
 
 
979 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  37.04 
 
 
314 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.51 
 
 
979 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  40.91 
 
 
379 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2086  ferredoxin  30.21 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2905  putative flavodoxin  43.48 
 
 
258 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  38.1 
 
 
828 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2921  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
253 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.51 
 
 
979 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1957  hypothetical protein  38.6 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00915  hitchhiker  0.000000199442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2387  hypothetical protein  38.6 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00833756  hitchhiker  0.0000441402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16530  hydrogenase, Fe-only  35.94 
 
 
569 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.143158  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.1 
 
 
399 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3099  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
369 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0141541  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 
955 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1209  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.46 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.94 
 
 
357 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.23 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  38.1 
 
 
815 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35 
 
 
290 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.15 
 
 
282 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1755  hypothetical protein  38.6 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1889  hypothetical protein  38.6 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  32.73 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  39.66 
 
 
303 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.68 
 
 
667 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  43.1 
 
 
421 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  35.71 
 
 
439 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.18 
 
 
502 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2339  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.73 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.51 
 
 
893 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.51 
 
 
900 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>