More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2150 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  78.71 
 
 		 406 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  78.22 
 
 		 406 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  84.24 
 
 		 411 aa  689    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  86.74 
 
 		 377 aa  651    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  85.47 
 
 		 403 aa  685    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  100 
 
 		 406 aa  826    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  86.7 
 
 		 406 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  47.8 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  40.85 
 
 		 408 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  43.05 
 
 		 403 aa  315  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  45.43 
 
 		 408 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  41.45 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  42.13 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  42.19 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  39.3 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  41.4 
 
 		 373 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  41.4 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  41.26 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  41.89 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  39.57 
 
 		 371 aa  278  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  41.44 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  39.78 
 
 		 370 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  40.5 
 
 		 371 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  41.44 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  41.44 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  38.77 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  41.44 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  41.44 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  41.44 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  41.44 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  41.44 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  41.71 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  41.4 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  42.42 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  41.18 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  41.44 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  40.59 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  38.08 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  39.04 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  40.32 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  38.04 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  40.6 
 
 		 374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  40.59 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  40.59 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  41.24 
 
 		 363 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  39.24 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  40.79 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  43.06 
 
 		 377 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  42.23 
 
 		 374 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  41.67 
 
 		 363 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  38.34 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  39.4 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 371 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  38.89 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  39.02 
 
 		 373 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  39.72 
 
 		 366 aa  253  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  39.19 
 
 		 370 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  41.35 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  38.44 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  42.51 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  39.19 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  40.53 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  42.32 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  37.23 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  42.51 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  42.5 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 373 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  37.26 
 
 		 371 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  38.61 
 
 		 372 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  37.07 
 
 		 371 aa  250  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  40.94 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  39.26 
 
 		 371 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  43.05 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  38.92 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  37.26 
 
 		 371 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  42.22 
 
 		 369 aa  249  7e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  37.87 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  37.26 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  37.26 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  39.21 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  37.14 
 
 		 371 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  38.27 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  40.91 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  36.9 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  38.79 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  37.9 
 
 		 371 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  37 
 
 		 371 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  38.52 
 
 		 371 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  38.07 
 
 		 371 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  36.73 
 
 		 371 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  38.52 
 
 		 371 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>