More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0827 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 399 aa  823    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0535  tryptophan synthase subunit beta  83.21 
 
 		 399 aa  699    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000244592  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0673  tryptophan synthase subunit beta  78.2 
 
 		 400 aa  659    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  86.72 
 
 		 399 aa  718    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0776  tryptophan synthase subunit beta  79.95 
 
 		 400 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  84.21 
 
 		 399 aa  703    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  82.96 
 
 		 399 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  66.16 
 
 		 402 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.12 
 
 		 409 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 409 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 413 aa  512  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 410 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 404 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  60.55 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  62.78 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  61.04 
 
 		 414 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 411 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  61.06 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 409 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  61.99 
 
 		 407 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  62.98 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 405 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  63.01 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 408 aa  501  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  61.79 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 410 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  61.89 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  60.9 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  61.64 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 407 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  61.35 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 		 397 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  60.9 
 
 		 422 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.73 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  60.88 
 
 		 406 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  59.5 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1990  tryptophan synthase subunit beta  60.2 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  62.63 
 
 		 399 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  61 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  63.17 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.65 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 406 aa  494  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 410 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  60.75 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 		 394 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  59.65 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  61.7 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  61.32 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>