248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1095 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1095  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1229  hypothetical protein  92.02 
 
 		 163 aa  308  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0921139  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  52.47 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2033  hypothetical protein  51.85 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1287  hypothetical protein  49.69 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00293096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  49.08 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  46.63 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  46.63 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  46.63 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  46.01 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  48.47 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  46.01 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  46.01 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  46.01 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  46.01 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  45.4 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  45.4 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  45.4 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  45.4 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  45.4 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  45.4 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  45.4 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  46.63 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  46.01 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  46.63 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1699  hypothetical protein  45.56 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1923  hypothetical protein  43.86 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3385  hypothetical protein  39.9 
 
 		 202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214146  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2746  hypothetical protein  38.97 
 
 		 212 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2013  hypothetical protein  40.31 
 
 		 202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000868215  normal  0.600676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2424  hypothetical protein  41.71 
 
 		 200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000350737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1245  hypothetical protein  41.36 
 
 		 197 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2988  hypothetical protein  40.21 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2132  hypothetical protein  37.82 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2563  hypothetical protein  41.49 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  hitchhiker  0.00397879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  43.67 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  43.87 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  43.15 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  43.05 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  40.51 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  40.26 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2751  hypothetical protein  38.24 
 
 		 295 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891527  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  39.87 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  39.87 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  39.87 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  39.87 
 
 		 154 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  39.87 
 
 		 154 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  39.24 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  39.24 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  39.24 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  39.24 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  39.24 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  39.24 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  38.46 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  39.24 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  39.24 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  39.87 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  39.24 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  39.24 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  39.24 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  39.61 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  39.24 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  46.55 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  38.12 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  37.34 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  40.94 
 
 		 272 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  38.96 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  35.9 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  36.54 
 
 		 201 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  40.62 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  40.62 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  44.04 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  37.34 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  36.54 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  40.35 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  44.04 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  42.11 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  32.56 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  40 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  36.84 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  35.06 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  43.12 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  35.19 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.44 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  41.32 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  41.03 
 
 		 286 aa  73.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  44.34 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  36.57 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  40.52 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  35 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  37.65 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  43.48 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  42.74 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  33.75 
 
 		 251 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  38.84 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  33.75 
 
 		 251 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  36.54 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  35.92 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>