28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4982 on replicon NC_008762
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 843 aa  1734    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  27.97 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  32.65 
 
 		 805 aa  101  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  26.25 
 
 		 650 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  30.63 
 
 		 743 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  25.88 
 
 		 651 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  27.5 
 
 		 713 aa  87.4  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  30.64 
 
 		 752 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.17 
 
 		 659 aa  85.1  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  29.2 
 
 		 746 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  29.2 
 
 		 746 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.09 
 
 		 635 aa  81.3  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  27.27 
 
 		 873 aa  77.8  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  43.75 
 
 		 899 aa  74.7  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  45 
 
 		 899 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  26.39 
 
 		 830 aa  70.1  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0329  hypothetical protein  44.32 
 
 		 623 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.03 
 
 		 521 aa  67.8  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.34 
 
 		 303 aa  63.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  30.91 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  31.87 
 
 		 1255 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.82 
 
 		 315 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  22.62 
 
 		 281 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  29.41 
 
 		 1389 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  29.41 
 
 		 1557 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7564  relaxase/mobilization nuclease family protein  37.11 
 
 		 1019 aa  45.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0784017  normal  0.290124 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  34.92 
 
 		 398 aa  45.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  36.23 
 
 		 443 aa  44.3  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>