More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4608 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
346 aa  703    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  74.71 
 
 
344 aa  527  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  75.15 
 
 
499 aa  525  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  72.54 
 
 
347 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.07 
 
 
343 aa  441  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.07 
 
 
343 aa  441  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  57.91 
 
 
338 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  57.91 
 
 
338 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  57.91 
 
 
338 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  57.91 
 
 
338 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  57.91 
 
 
338 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  57.91 
 
 
338 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  55.69 
 
 
343 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.3 
 
 
341 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.3 
 
 
341 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  51.64 
 
 
341 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  51.64 
 
 
341 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 
338 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2266  transposase IS116/IS110/IS902  67.93 
 
 
284 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  51.19 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.19 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.19 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.19 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.19 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.19 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
338 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
338 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
338 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
338 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
338 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
338 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
338 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
338 aa  338  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  49.1 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  49.1 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  49.1 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  49.1 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  52.2 
 
 
322 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  49.7 
 
 
342 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 
342 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 
342 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 
342 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  49.7 
 
 
342 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.5 
 
 
340 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.8 
 
 
338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  48.2 
 
 
338 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.2 
 
 
338 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.9 
 
 
338 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.9 
 
 
338 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.9 
 
 
338 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  50.75 
 
 
341 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.6 
 
 
338 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.4 
 
 
342 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  52.21 
 
 
348 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.21 
 
 
348 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  49.14 
 
 
365 aa  318  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  49.1 
 
 
340 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  49.14 
 
 
365 aa  318  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.4 
 
 
356 aa  319  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.48 
 
 
338 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  47.93 
 
 
338 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  48.8 
 
 
340 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  48.8 
 
 
340 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  48.49 
 
 
340 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  48.8 
 
 
340 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  48.8 
 
 
340 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  48.8 
 
 
340 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  48.8 
 
 
340 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  48.8 
 
 
340 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.65 
 
 
340 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.71 
 
 
338 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  52.71 
 
 
341 aa  316  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3274  ISPsy7, transposase  48.49 
 
 
340 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.88 
 
 
356 aa  316  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.71 
 
 
311 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  52.41 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  52.41 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  46.67 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.67 
 
 
350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.67 
 
 
350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.67 
 
 
350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.67 
 
 
350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.67 
 
 
350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  47.89 
 
 
340 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  47.76 
 
 
455 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09760  Transposase, IS111A/IS1328/IS1533  48.77 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.75 
 
 
338 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.75 
 
 
338 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.03 
 
 
336 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  47.72 
 
 
340 aa  308  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  47.15 
 
 
343 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  48.81 
 
 
345 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  47.51 
 
 
343 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  47.51 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  51.19 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  48.35 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  48.35 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  48.35 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  48.35 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  48.35 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>