More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4363 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  86.32 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  86.32 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  86.32 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  76.6 
 
 		 99 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  76.6 
 
 		 99 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  68.75 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  68.75 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  84.42 
 
 		 80 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  67.71 
 
 		 99 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  67.71 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3877  transposase IS3/IS911 family protein  83.12 
 
 		 80 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419535  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  80.52 
 
 		 80 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  63.44 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  67.74 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  67.74 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  67.74 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  67.74 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  67.74 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  67.74 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  67.74 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  58.7 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  58.7 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  58.7 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  58.7 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  58.7 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  58.7 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  58.7 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  53.54 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  53.54 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  52.53 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  52.53 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  52.53 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  50 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  50.52 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  51.19 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  51.19 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  51.19 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  51.19 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  49.46 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  49.49 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  46.32 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  47.96 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  48.91 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  48.91 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3643  transposase  59.09 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  45.45 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  43.62 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  44.21 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7044  transposase IS3/IS911 family protein  47.19 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  44.21 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  47.19 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  47.19 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  45.56 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  46.24 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  46.07 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  45.05 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 107 aa  66.6  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 107 aa  66.6  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>