More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3877 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3877  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419535  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 
97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 
97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 
97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  93.75 
 
 
80 aa  149  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  93.75 
 
 
80 aa  149  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  83.12 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  73.75 
 
 
99 aa  117  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  73.75 
 
 
99 aa  117  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  74.03 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  74.03 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  70.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  70.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  70.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  70.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  70.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  70.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  70.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  66.23 
 
 
99 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  66.23 
 
 
98 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  61.04 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  53.25 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  53.25 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  53.25 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  53.25 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  53.25 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  53.25 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  53.25 
 
 
106 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  56.25 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  56.25 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  56.25 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  56.25 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  51.35 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  49.38 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  49.38 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  49.28 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  47.89 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  47.3 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  45.83 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3643  transposase  55.77 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  44.87 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  44.3 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
109 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
109 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
109 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
109 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
109 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
109 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
109 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0550  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  40.51 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1320  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7044  transposase IS3/IS911 family protein  46.97 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  41.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  40.79 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  41.89 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  35.53 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  35.53 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>