More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2268 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0579  ISRSO8-transposase orfA protein  100 
 
 		 97 aa  193  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1550  ISRSO8-transposase orfA protein  100 
 
 		 97 aa  193  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2268  ISRSO8-transposase orfA protein  100 
 
 		 97 aa  193  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0547  ISRSO8-transposase orfA protein  100 
 
 		 97 aa  193  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0674  putative transposase  78.35 
 
 		 96 aa  150  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.635959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4962  transposase IS3/IS911 family protein  84.54 
 
 		 97 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4891  transposase IS3/IS911 family protein  84.54 
 
 		 97 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  62.37 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  62.37 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  59.14 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  59.14 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  57.3 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  57.3 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  57.3 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  57.3 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  57.3 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  57.3 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  57.3 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  60.67 
 
 		 101 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  56.38 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  56.38 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  56.38 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  55.43 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  55.43 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  56.67 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  56.67 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  56.67 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  56.67 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  56.67 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  56.67 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  56.67 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  52.13 
 
 		 97 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  50.54 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  50.54 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  50.54 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  51.61 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  51.61 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  59.46 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  59.15 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3877  transposase IS3/IS911 family protein  56.76 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419535  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  41.67 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  40.45 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  43.48 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  43.48 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  43.48 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  38.54 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3643  transposase  53.12 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  41.24 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1654  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0261  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.269941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1537  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  hitchhiker  0.00103229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1098  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0825  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.638038  normal  0.192299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  39.58 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  41.67 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  41.67 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.41 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.41 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.41 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  43.18 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0630  transposase IS3/IS911  39.18 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4461  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1074  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0131  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0655  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1119  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1728  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>