69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1957 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2809  putative sensor protein  65.1 
 
 		 591 aa  732    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1957  formyl transferase domain-containing protein  100 
 
 		 602 aa  1231    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4101  formyl transferase-like  52.92 
 
 		 565 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2450  formyl transferase domain-containing protein  54.75 
 
 		 590 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2013  formyl transferase domain-containing protein  50.17 
 
 		 575 aa  548  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1541  formyl transferase-like protein  52.72 
 
 		 579 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00137712  normal  0.223229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3963  formyl transferase  50.58 
 
 		 558 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3348  formyl transferase-like protein  41.46 
 
 		 588 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0525  hydrogenase regulation HoxX  40.14 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1425  NiFe-hydrogenase maturation factor, HypX/HoxX type  36.41 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4501  formyl transferase domain-containing protein  37.98 
 
 		 564 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.76 
 
 		 572 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00720  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 		 955 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1209  formyl transferase domain-containing protein  32.7 
 
 		 284 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.111228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 286 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  29.25 
 
 		 315 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  25.54 
 
 		 263 aa  51.6  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  28.32 
 
 		 268 aa  51.2  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  22.76 
 
 		 314 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  21.08 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  20.8 
 
 		 314 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  23.53 
 
 		 304 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 260 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  22.71 
 
 		 314 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  22.76 
 
 		 314 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  27.13 
 
 		 261 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  22.71 
 
 		 314 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  22.71 
 
 		 314 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1610  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 266 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  22.71 
 
 		 314 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  22.71 
 
 		 314 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0641  methionyl-tRNA formyltransferase  21.89 
 
 		 310 aa  48.5  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.95 
 
 		 260 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.31 
 
 		 270 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  30.82 
 
 		 261 aa  47.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  22.31 
 
 		 314 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3243  naphthoate synthase  27.2 
 
 		 320 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.106929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  28.12 
 
 		 328 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  23.08 
 
 		 314 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  19.84 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  26.98 
 
 		 316 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  25.27 
 
 		 326 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 268 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  26.39 
 
 		 261 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  24.21 
 
 		 306 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  22.1 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.59 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  24.4 
 
 		 254 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0385  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.9 
 
 		 243 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 		 277 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  20.34 
 
 		 255 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 		 260 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 		 277 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4186  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.93 
 
 		 269 aa  45.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0308671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 		 277 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.21 
 
 		 255 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  22.43 
 
 		 359 aa  45.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  22.16 
 
 		 318 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2953  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  23.98 
 
 		 259 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1748  short chain enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 		 258 aa  44.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.76 
 
 		 257 aa  44.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5268  methionyl-tRNA formyltransferase  20.99 
 
 		 313 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0531  naphthoate synthase  26.89 
 
 		 317 aa  44.3  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0787975  normal  0.016512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 		 263 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.55 
 
 		 262 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  26.51 
 
 		 263 aa  43.9  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0279  formyl transferase domain protein  28.12 
 
 		 309 aa  43.9  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.86 
 
 		 260 aa  43.9  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 		 258 aa  43.5  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>