More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0761 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0761  ribosomal protein L17  100 
 
 
128 aa  256  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1365  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1321  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1109  50S ribosomal protein L17  50 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000625282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0982  50S ribosomal protein L17  51.18 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  47.58 
 
 
117 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  43.31 
 
 
141 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  44.53 
 
 
131 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  44.09 
 
 
142 aa  106  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  45.31 
 
 
126 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  43.31 
 
 
141 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  45.31 
 
 
126 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  44.09 
 
 
142 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  43.75 
 
 
128 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  44.09 
 
 
142 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
132 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  49.19 
 
 
117 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 
140 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 
140 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  45.97 
 
 
131 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
132 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  42.97 
 
 
131 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  41.73 
 
 
143 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0294  50S ribosomal protein L17  48 
 
 
118 aa  103  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133878  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  42.64 
 
 
141 aa  103  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  42.19 
 
 
138 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
132 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
132 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0290  ribosomal protein L17  43.55 
 
 
117 aa  102  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  47.58 
 
 
194 aa  101  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
129 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
190 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  42.19 
 
 
129 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  40 
 
 
136 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 
133 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  45.38 
 
 
176 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  46.09 
 
 
132 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  45.16 
 
 
126 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
190 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
132 aa  100  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  40.94 
 
 
140 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  41.09 
 
 
138 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  44.53 
 
 
131 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  42.97 
 
 
129 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  42.97 
 
 
129 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 
131 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  42.52 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  40.31 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  42.02 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  40 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
132 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  42.52 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  43.31 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  45.16 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  42.97 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  41.41 
 
 
133 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  38.58 
 
 
137 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  42.97 
 
 
132 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  42.19 
 
 
132 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  39.84 
 
 
139 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
133 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  40.94 
 
 
140 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  43.75 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 
127 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  44.09 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  42.52 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  41.94 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
175 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  42.19 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 
178 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  38.28 
 
 
135 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  39.37 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 
131 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>