247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2780 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  100 
 
 		 284 aa  586  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  66.3 
 
 		 277 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  67.03 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  65.94 
 
 		 277 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  66.67 
 
 		 273 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  66.06 
 
 		 273 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  66.06 
 
 		 273 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  67.4 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  66.31 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  66.55 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  57.95 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  58.33 
 
 		 276 aa  315  5e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  58.33 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  51.45 
 
 		 280 aa  288  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  49.65 
 
 		 289 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  51.7 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  51.7 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  51.7 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  51.7 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  51.11 
 
 		 279 aa  285  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  51.1 
 
 		 277 aa  284  9e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  51.32 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  50.56 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  50 
 
 		 290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  50.19 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  50.19 
 
 		 276 aa  281  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  49.07 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  49.25 
 
 		 282 aa  279  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  50.57 
 
 		 275 aa  278  9e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  55.68 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  48.92 
 
 		 282 aa  275  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  47.6 
 
 		 272 aa  275  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  49.26 
 
 		 289 aa  274  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  48.93 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  52.65 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  48.89 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  51.69 
 
 		 276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  49.43 
 
 		 276 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  51.45 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  48.33 
 
 		 271 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  45.79 
 
 		 273 aa  258  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  47.65 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  46.21 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  48.87 
 
 		 294 aa  257  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  47 
 
 		 288 aa  252  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  46.32 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  47.48 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  51.34 
 
 		 273 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  49.07 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  47.39 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  39.93 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  46.97 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30340  potassium channel  64.74 
 
 		 186 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.051354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  45.32 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  45.9 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  48.73 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  44.41 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  49.6 
 
 		 258 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  45.72 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  42.44 
 
 		 277 aa  221  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  47.25 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  47.25 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  38.66 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  38.66 
 
 		 278 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  38.66 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  38.66 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  38.66 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  45.38 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  40.89 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  44.63 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  36.84 
 
 		 289 aa  188  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  35.14 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  34.39 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  34.78 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  30.8 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  32.7 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  32.77 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  30.37 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  31.19 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  34.41 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  30.67 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30350  potassium channel  59.57 
 
 		 106 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  34.51 
 
 		 419 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  33.6 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  29.55 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  34.67 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  28.92 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  39.15 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  30.38 
 
 		 269 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 408 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  32.65 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.13 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  30.45 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  32.33 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  31.47 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  29.39 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  31.63 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 412 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  28.9 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  28.96 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>