160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2465 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 152 aa  295  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  74.34 
 
 		 154 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  74.34 
 
 		 154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  64.9 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  65.33 
 
 		 152 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  63.33 
 
 		 151 aa  183  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  63.58 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  61.33 
 
 		 151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  62.25 
 
 		 152 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  61.59 
 
 		 152 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  55.26 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.31 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.58 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.51 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.91 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  35.29 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  38.85 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  34.9 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  35.57 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.34 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.06 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  38.06 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  38.06 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  31.79 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  38.62 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.8 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  33.33 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  39.55 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  38.85 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  38.21 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  38.85 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  32.91 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.03 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  34.03 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.03 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  38.46 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.19 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  39.55 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.46 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.1 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.46 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.77 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.59 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  31.08 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.69 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.1 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.1 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.58 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.04 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.77 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  27.63 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.29 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.93 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.86 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1998  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.66 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  36.59 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.59 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.59 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.59 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.7 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.89 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.15 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.51 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.89 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0829  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.02 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  28 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1310  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.02 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1292  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.02 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.1 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4453  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.19 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.5 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.67 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.29 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.29 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.39 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.29 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  24.22 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.29 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.82 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.73 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0303  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.78 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0314  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  44.78 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.29 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  33.55 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.88 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  41.12 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.96 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  35.54 
 
 		 216 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>