More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2276 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2276  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0906635  hitchhiker  0.00967543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47070  CinA-related protein  56.96 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.797955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0608  CinA, C-terminal  50.62 
 
 		 259 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4777  CinA domain-containing protein  51.52 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0164  competence/damage-inducible protein CinA  50.31 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3298  CinA domain-containing protein  47.17 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3003  CinA domain-containing protein  47.17 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2431  CinA domain-containing protein  45.91 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.197767  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2789  CinA-like  43.48 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36880  putative ompetence-damaged protein  44.94 
 
 		 172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3170  CinA domain-containing protein  43.67 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  43.51 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  42.57 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  44.08 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  43.24 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  43.75 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  42.67 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  44.53 
 
 		 418 aa  103  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  42.58 
 
 		 420 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  42 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  44.44 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  44.44 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  43.06 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  44.2 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  41.67 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  41.5 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  38.31 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3132  competence damage-inducible protein A  38.78 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  40.97 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  42.25 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  40.79 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  40.79 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  40.79 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  40.79 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  40.79 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  40.79 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  40.79 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  42.03 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  44.37 
 
 		 431 aa  99.4  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  42.36 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  42.36 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  39.33 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  40.27 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  40.79 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  41.67 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  41.67 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  43.45 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  48.96 
 
 		 208 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  39.86 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  44.44 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  40.97 
 
 		 166 aa  97.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  44.44 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  41.67 
 
 		 184 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  39.58 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  41.89 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  40.82 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  41.89 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  37.76 
 
 		 411 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  41.89 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  40.43 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  40.28 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  40.43 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  41.22 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  40.14 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.61 
 
 		 429 aa  95.5  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  38.41 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  39.47 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  46.27 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  43.48 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  40.14 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  40.14 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  40.14 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  40.14 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  47.92 
 
 		 203 aa  94.4  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  40.14 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  40.14 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  40.14 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  41.22 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  50 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 414 aa  93.2  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  41.79 
 
 		 436 aa  93.2  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  38.1 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  38.89 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  41.61 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  41.61 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  41.61 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  47.37 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  35.1 
 
 		 408 aa  92  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  41.45 
 
 		 423 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  36.81 
 
 		 430 aa  92  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  44.68 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  57.14 
 
 		 178 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1593  CinA-like  37.84 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  45.83 
 
 		 208 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  42.96 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  34.44 
 
 		 408 aa  90.5  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  40.88 
 
 		 168 aa  90.5  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  34.72 
 
 		 413 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  43.28 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  38.78 
 
 		 275 aa  90.1  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>