140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1444 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  100 
 
 
165 aa  328  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  63.19 
 
 
167 aa  184  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  52.76 
 
 
174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  52.15 
 
 
174 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  44.1 
 
 
163 aa  144  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  48.77 
 
 
162 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  45.34 
 
 
165 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.15 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  40.62 
 
 
165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.01 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  40.76 
 
 
162 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.75 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.75 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.04 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.98 
 
 
165 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.92 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  41.88 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.77 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.75 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.51 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3718  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.89 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1383  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.74 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2477  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.74 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0670755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1521  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  48.17 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00868483  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.85 
 
 
166 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.42 
 
 
164 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  45.18 
 
 
172 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.13 
 
 
163 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0362047  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3131  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.95 
 
 
162 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  44.72 
 
 
162 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1588  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.39 
 
 
162 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1103  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.5 
 
 
175 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.1 
 
 
168 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.87 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.87 
 
 
171 aa  98.2  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.27 
 
 
168 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5265  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.12 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.72 
 
 
162 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  41.61 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  46.36 
 
 
163 aa  90.9  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955338  normal  0.798381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3906  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.74 
 
 
173 aa  90.5  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3474  potassium efflux system protein PhaE, putative  40.12 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3255  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.65 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.314068  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.93 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4613  cation antiporter  34.78 
 
 
162 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  hitchhiker  0.00748175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1602  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.81 
 
 
163 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.53 
 
 
157 aa  87  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5153  cation antiporter  37.42 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.82 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  29.7 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.06 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5078  cation antiporter  36.05 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.13 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2442  multicomponent K+:H+ antiporter subunit E, pH adaptation  34.97 
 
 
172 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.540831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.13 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  38 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.4 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  28.06 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.35 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  33.33 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  36 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.1 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3313  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.29 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3622  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.62 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.022105  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.42 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  0.241168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.7 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  28.48 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.67 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  31.13 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  29.73 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1850  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.61 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0391137 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  26.06 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.03 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2227  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.7 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3712  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.06 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.33 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  28.76 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.06 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  0.146905 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  29.14 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  31.65 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.7 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.25 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3513  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.7 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  27.4 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  32.35 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.03 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.03 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  28.76 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.36 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  27.61 
 
 
201 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.33 
 
 
158 aa  61.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2809  cation antiporter  28.4 
 
 
161 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.492713 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  29.93 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.9 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  28.26 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2931  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  29.67 
 
 
139 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  32.61 
 
 
159 aa  54.3  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1732  cation antiporter  35.87 
 
 
125 aa  54.3  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  23.57 
 
 
157 aa  54.3  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  35.63 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>