52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4227 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  100 
 
 		 756 aa  1506    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  29.23 
 
 		 1328 aa  85.5  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.2 
 
 		 831 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.02 
 
 		 1343 aa  77.4  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.21 
 
 		 958 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.51 
 
 		 1148 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  38.41 
 
 		 1133 aa  67.4  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32 
 
 		 1224 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1094 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  29.79 
 
 		 773 aa  65.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3584  HEAT domain containing protein  30.06 
 
 		 375 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.755925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.7 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.65 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.61 
 
 		 644 aa  57.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  33.57 
 
 		 522 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  29.78 
 
 		 1475 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.7 
 
 		 1181 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.45 
 
 		 251 aa  54.7  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1234 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  28.79 
 
 		 321 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  34.92 
 
 		 838 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.85 
 
 		 321 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.89 
 
 		 524 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.82 
 
 		 192 aa  53.5  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  34.67 
 
 		 546 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.89 
 
 		 501 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.91 
 
 		 399 aa  51.6  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.7 
 
 		 157 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.32 
 
 		 1235 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  29.55 
 
 		 325 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.24 
 
 		 285 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.93 
 
 		 510 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.67 
 
 		 1139 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.32 
 
 		 1235 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.94 
 
 		 302 aa  48.9  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.85 
 
 		 214 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 321 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1340  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 		 278 aa  47.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.63 
 
 		 1412 aa  47.8  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.88 
 
 		 377 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.08 
 
 		 375 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  28.68 
 
 		 431 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2231  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.08 
 
 		 335 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.08 
 
 		 375 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.08 
 
 		 375 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  29 
 
 		 200 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3250  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 		 941 aa  45.8  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308767  normal  0.185977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.82 
 
 		 208 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.31 
 
 		 1110 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.06 
 
 		 221 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  28.14 
 
 		 643 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.67 
 
 		 370 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>