43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4007 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1229    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  37.18 
 
 		 530 aa  291  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  29.53 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  26.54 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  26.65 
 
 		 442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 		 447 aa  117  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  26.28 
 
 		 489 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  23.99 
 
 		 934 aa  89.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  25.14 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  25.53 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  27.91 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.99 
 
 		 1812 aa  56.6  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  20.1 
 
 		 420 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  24.18 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  25 
 
 		 556 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  23.7 
 
 		 432 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.16 
 
 		 484 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.36 
 
 		 395 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.36 
 
 		 395 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.51 
 
 		 415 aa  47.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 431 aa  47.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.34 
 
 		 393 aa  47.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  27.33 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  29.84 
 
 		 718 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.6 
 
 		 352 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.97 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.98 
 
 		 395 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  27.08 
 
 		 453 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.37 
 
 		 1241 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.55 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.76 
 
 		 463 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.25 
 
 		 395 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  32 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.04 
 
 		 393 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.04 
 
 		 393 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.43 
 
 		 393 aa  44.3  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.38 
 
 		 414 aa  43.5  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  21.43 
 
 		 774 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  22.47 
 
 		 499 aa  43.9  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  22.47 
 
 		 499 aa  43.9  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  24.63 
 
 		 475 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>