79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2951 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  100 
 
 		 459 aa  920    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  42.82 
 
 		 416 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  42.45 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  31.85 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  31.85 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  31.85 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  31.85 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  31.85 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  31.85 
 
 		 425 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  31.85 
 
 		 425 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  31.4 
 
 		 425 aa  176  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  31.4 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  31 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  31 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  31 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  31 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  31 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  29.31 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  29.8 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  31.06 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  30.63 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  30.88 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  28.74 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  30.05 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  31.28 
 
 		 410 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  29.79 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  31.57 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  29.83 
 
 		 412 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  27.23 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  30.92 
 
 		 414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  30.24 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  27.27 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  28.04 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  25.93 
 
 		 411 aa  124  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  26.33 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  26.33 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  25.84 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  25.58 
 
 		 418 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  26.59 
 
 		 422 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  25.58 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  25.37 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  25.37 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  25.37 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  24.46 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  24.68 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  24.74 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  22.53 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  24.57 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  24.35 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  24.35 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  22.53 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  23.09 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  24.35 
 
 		 418 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  24.35 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  24.31 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  24.31 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  24.31 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  24.31 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  24.31 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  24.31 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  24.31 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  24.31 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  24.1 
 
 		 418 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  22.73 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  19.64 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  19.41 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  22.54 
 
 		 382 aa  50.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  19.63 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  25 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1158  hypothetical protein  23.31 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>