More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1333 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1333  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  38.1 
 
 
165 aa  94  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  37.41 
 
 
139 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  36.97 
 
 
139 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.29 
 
 
177 aa  87.8  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
139 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.65 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0847  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.67 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.879675  normal  0.609652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
284 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
226 aa  80.9  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.34 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.17 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4037  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.77 
 
 
513 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.57 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.59 
 
 
300 aa  79  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.43 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2619  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I  32.75 
 
 
427 aa  78.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487115  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  33.96 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.63 
 
 
254 aa  77.8  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.46 
 
 
507 aa  77.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
267 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.340666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1272  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
270 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.65 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.41 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.478766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.36 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  31.25 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.06 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.31 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  30.56 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  30.56 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  30.56 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  30.56 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  30.56 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  30.92 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  32.56 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  32.14 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1026  hypothetical protein  30 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  31.91 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  29.45 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  29.86 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  29.86 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  29.86 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  35.58 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.65 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  31.88 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  34.33 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  29.17 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  35.58 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.06 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  35.58 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  32.84 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  32.74 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  29.79 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  29.79 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  29.79 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  29.79 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.38 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000162205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  29.73 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  29.79 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  29.79 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.48 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  29.94 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.87 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_799  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain I)  35.83 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0812  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.83 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  29.66 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  27.44 
 
 
207 aa  70.9  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  30.14 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  29.79 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0748  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  26.84 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0663898  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  32.71 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  33.59 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  28.77 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  40.22 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.69 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  29.29 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>