139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3089 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3089  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 252 aa  517  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  37.04 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1846  Phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  decreased coverage  0.00463993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2170  Phosphoglycerate mutase  36.29 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00522572  normal  0.0339926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3186  putative phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1369  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1155  putative phosphoglycerate mutase  33.2 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0632256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0713  putative phosphoglycerate mutase  33.2 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.107866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0438  putative phosphoglycerate mutase  33.2 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2015  putative phosphoglycerate mutase protein  36.69 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.458682  normal  0.0388095 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1461  phosphoglycerate mutase family protein  33.2 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1315  phosphoglycerate mutase family protein  33.2 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1324  phosphoglycerate mutase family protein  33.2 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1804  phosphoglycerate mutase, putative  32.79 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  34.54 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1008  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.54 
 
 		 241 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1085  phosphoglycerate mutase, putative  33.61 
 
 		 237 aa  95.5  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.59 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.59 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 591 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.65 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.01 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.01 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.44 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.2 
 
 		 444 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  28.51 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.23 
 
 		 442 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 447 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.12 
 
 		 449 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  28.72 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.81 
 
 		 443 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  28.22 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  26.26 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  27.61 
 
 		 202 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  30.28 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  24.62 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.33 
 
 		 547 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  27.61 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  27.61 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  27.61 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  32.61 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.74 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  24.74 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  24.74 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  24.74 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  24.74 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  24.74 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.38 
 
 		 175 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  25.25 
 
 		 200 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  28.05 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  32.26 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  24.74 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  24.74 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  31.14 
 
 		 410 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  39.13 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  25.59 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34127  putative phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.375403 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.78 
 
 		 175 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.78 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  25.87 
 
 		 452 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0362  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  24.04 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  26.91 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  29 
 
 		 198 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>