More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2237 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2237  polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
417 aa  837    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0695  polynucleotide adenylyltransferase region  51.44 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357967  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1612  polynucleotide adenylyltransferase region  44.82 
 
 
415 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.919779  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1553  polyA polymerase family protein  44.2 
 
 
423 aa  318  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1501  polyA polymerase family protein  44.89 
 
 
405 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3053  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.2 
 
 
417 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0413864 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1006  tRNA-nucleotidyltransferase  39.39 
 
 
417 aa  306  6e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.947871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3226  poly(A) polymerase  43.71 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2272  polynucleotide adenylyltransferase region  42.24 
 
 
419 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.554028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0729  polynucleotide adenylyltransferase region  42.72 
 
 
419 aa  297  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2275  putative poly(A) polymerase  44.05 
 
 
417 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302951  normal  0.321254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1380  Polynucleotide adenylyltransferase region  45.57 
 
 
418 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2789  Polynucleotide adenylyltransferase region  44.58 
 
 
422 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.195532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1196  polynucleotide adenylyltransferase region  43.61 
 
 
418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.689615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1299  polynucleotide adenylyltransferase region  44.12 
 
 
417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3247  polynucleotide adenylyltransferase region  43.06 
 
 
418 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2622  polynucleotide adenylyltransferase region  42.34 
 
 
418 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0920  polynucleotide adenylyltransferase region  43.56 
 
 
417 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2176  polynucleotide adenylyltransferase region  42.43 
 
 
409 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2010  polynucleotide adenylyltransferase region  46.07 
 
 
389 aa  269  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2110  polynucleotide adenylyltransferase region  43.86 
 
 
398 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402198  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2952  polynucleotide adenylyltransferase region  42.44 
 
 
406 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392505  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1021  polynucleotide adenylyltransferase region  43.36 
 
 
400 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0790  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.1 
 
 
419 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0439573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2846  polynucleotide adenylyltransferase region  43.37 
 
 
417 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0310585  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0109  polynucleotide adenylyltransferase region  41.9 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0125148  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0444  poly A polymerase family protein  37.56 
 
 
391 aa  253  3e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0366  polynucleotide adenylyltransferase region  41.01 
 
 
525 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2891  polynucleotide adenylyltransferase region  40.92 
 
 
386 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3015  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.08 
 
 
420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684441  normal  0.443842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5176  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.24 
 
 
417 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0646  polyA polymerase family protein  35.73 
 
 
392 aa  239  5e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4475  polynucleotide adenylyltransferase region  43.96 
 
 
418 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  hitchhiker  0.001883 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0892  polynucleotide adenylyl transferase  33.16 
 
 
396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2866  polynucleotide adenylyltransferase region  53.21 
 
 
380 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1461  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.71 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0081  polynucleotide adenylyltransferase protein  42.47 
 
 
379 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3489  CCA-adding enzyme  53.01 
 
 
382 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2643  polynucleotide adenylyltransferase region  43.47 
 
 
380 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1205  Poly A polymerase family protein  52.45 
 
 
380 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0601  polynucleotide adenylyltransferase region  41.39 
 
 
412 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130653  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1464  polynucleotide adenylyltransferase region  40.4 
 
 
424 aa  222  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.113591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2575  polynucleotide adenylyltransferase region  52.24 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1741  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.44 
 
 
428 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.676657  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1116  polyA polymerase/tRNA nucleotidyltransferase family protein  32.31 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.172722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.44 
 
 
427 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.13 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  30.1 
 
 
427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.76 
 
 
399 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.78 
 
 
398 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 
448 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  29.46 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  33.22 
 
 
394 aa  133  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  36.41 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.5 
 
 
403 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1516  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.71 
 
 
400 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1545  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.71 
 
 
400 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00353359  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.29 
 
 
402 aa  130  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.14 
 
 
402 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  39.43 
 
 
434 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 
464 aa  123  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.68 
 
 
584 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.02 
 
 
459 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
465 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  37.84 
 
 
436 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  34.93 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.26 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  35.36 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
552 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
473 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.7 
 
 
467 aa  119  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  40.67 
 
 
436 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  40.19 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  36.44 
 
 
490 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
484 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
499 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.27 
 
 
473 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  24.59 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.88 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1341  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.36 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.293124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1654  tRNA cytidylyltransferase  43.48 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 
492 aa  114  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.2 
 
 
404 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.65 
 
 
404 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  29.57 
 
 
424 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  29.57 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  34.25 
 
 
510 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.73 
 
 
490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1665  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.65 
 
 
397 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1703  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.65 
 
 
397 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.026033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1446  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.19 
 
 
397 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1418  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.19 
 
 
397 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1559  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.19 
 
 
397 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.19 
 
 
397 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1630  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.19 
 
 
397 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.16656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2393  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.59 
 
 
529 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 
487 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>