More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2103 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  704    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40.39 
 
 		 684 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.29 
 
 		 831 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.8 
 
 		 416 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  40.15 
 
 		 1402 aa  170  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.46 
 
 		 557 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.23 
 
 		 528 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.55 
 
 		 961 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.26 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.96 
 
 		 789 aa  160  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.93 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.69 
 
 		 685 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  40.98 
 
 		 380 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.84 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.82 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40.18 
 
 		 2413 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.12 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1493 aa  152  8e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1037 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.7 
 
 		 425 aa  145  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  37.83 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.93 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.59 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.62 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.98 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 1032 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.88 
 
 		 1002 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.14 
 
 		 490 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.07 
 
 		 490 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.04 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.34 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.82 
 
 		 523 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.39 
 
 		 271 aa  132  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.2 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  34.38 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  34.9 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.93 
 
 		 838 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  32.03 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  35.86 
 
 		 679 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.68 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.12 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 976 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.11 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  31.9 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  36.99 
 
 		 1877 aa  124  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  31.85 
 
 		 368 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.98 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.46 
 
 		 890 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  33.87 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.86 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.48 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  32.06 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.99 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.77 
 
 		 278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.55 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  34.55 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.16 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  31.5 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  30.86 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.08 
 
 		 552 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.16 
 
 		 185 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  28.86 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.86 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  32.86 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  34.15 
 
 		 285 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.77 
 
 		 264 aa  116  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  35.48 
 
 		 680 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35.35 
 
 		 254 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  34.12 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.41 
 
 		 232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.91 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 		 705 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  31.27 
 
 		 387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  34.96 
 
 		 961 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  32.93 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.44 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  34.71 
 
 		 839 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.82 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  34.31 
 
 		 839 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34.54 
 
 		 1430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.46 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  29.92 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.56 
 
 		 208 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  31.6 
 
 		 1044 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.6 
 
 		 1078 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.47 
 
 		 358 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  37.07 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  28.4 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  28.4 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.73 
 
 		 865 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  40.54 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.44 
 
 		 392 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.5 
 
 		 347 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  36.8 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.91 
 
 		 241 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>