262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1636 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.13 
 
 
222 aa  231  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3148  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.14 
 
 
211 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  41 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  26.63 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  33.5 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5027  FMN reductase, NADPH-dependent  27.96 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5265  FMN reductase, NADPH-dependent  27.96 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5408  FMN reductase, NADPH-dependent  27.96 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  30.98 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  33.16 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4971  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.96 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
179 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  35.24 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4857  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  27.96 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4872  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  27.42 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  34.44 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1202  hypothetical protein  25.54 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727193  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5340  FMN reductase, NADPH-dependent  26.88 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  35.9 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5282  FMN reductase, NADPH-dependent  27.42 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  28.99 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5662  FMN reductase, NADPH-dependent  27.42 
 
 
181 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5295  FMN reductase, NADPH-dependent  28.34 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  28.21 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  28.99 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  35.29 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  35.29 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  26 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  30.28 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  28.1 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  32.73 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  27.21 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
172 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
194 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  36.36 
 
 
194 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  30.09 
 
 
182 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.56 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  33.64 
 
 
206 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
190 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  27.59 
 
 
173 aa  62  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.09 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
177 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  36.63 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 
184 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  27.45 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  24.16 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  32.35 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  24.69 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
207 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
187 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.81 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
192 aa  58.9  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  30.63 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  34.95 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 
211 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
190 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
224 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  22.63 
 
 
189 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  24.46 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
220 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
195 aa  58.2  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  35.64 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  32.65 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  27.69 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  31.47 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>