137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3148 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3148  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
211 aa  441  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1636  NADPH-dependent FMN reductase  53.14 
 
 
214 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.76 
 
 
222 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4971  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.59 
 
 
181 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5027  FMN reductase, NADPH-dependent  26.8 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5408  FMN reductase, NADPH-dependent  26.8 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5265  FMN reductase, NADPH-dependent  26.8 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  27.14 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5282  FMN reductase, NADPH-dependent  26.15 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4857  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  26.67 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4872  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  26.29 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5340  FMN reductase, NADPH-dependent  28.82 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5662  FMN reductase, NADPH-dependent  29.24 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1202  hypothetical protein  28.98 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727193  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5295  FMN reductase, NADPH-dependent  28.65 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  35.45 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  25.81 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  35.54 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  31.53 
 
 
179 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  29.57 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  34.91 
 
 
178 aa  62  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  33.64 
 
 
185 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  30.33 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  30.48 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1845  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 
152 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1552  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  32.21 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  26.88 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  27.92 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  28.17 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0441  iron-sulfur flavoprotein  28.49 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3301  hypothetical protein  29.82 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
184 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  23.71 
 
 
191 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1183  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
162 aa  52  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
207 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
177 aa  51.6  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  22.73 
 
 
189 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  29.73 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  22.46 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  24.62 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  23.53 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  22.84 
 
 
193 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  26.11 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  24.35 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  23.19 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  24.21 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  23.53 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  31.15 
 
 
173 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  28.35 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
190 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  26.36 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  24.67 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  27.09 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  26.45 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  30.77 
 
 
194 aa  48.9  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  27.94 
 
 
214 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.06 
 
 
193 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  25.74 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  26.8 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  28.83 
 
 
190 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.4 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  27.21 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  30.1 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  24.38 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  29.95 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0624  hypothetical protein  21.76 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0639  hypothetical protein  21.76 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  26.42 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  25.55 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  22.4 
 
 
187 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  27.41 
 
 
217 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0120  hypothetical protein  29.46 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  25.81 
 
 
178 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  27.21 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  27.91 
 
 
223 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  25.71 
 
 
211 aa  45.1  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  29.91 
 
 
199 aa  45.1  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  26.79 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  26.04 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>