235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3301 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3301  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0713  hypothetical protein  55.21 
 
 
201 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00905  hypothetical protein  48.98 
 
 
196 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.98 
 
 
196 aa  205  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00912  hypothetical protein  48.98 
 
 
196 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.258125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2695  hypothetical protein  48.98 
 
 
196 aa  205  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.59295  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0979  hypothetical protein  48.47 
 
 
196 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.58351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3177  hypothetical protein  51.3 
 
 
203 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4553  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.59 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.19 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.4 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.5 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.335878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0422  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  37.5 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.36 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.82 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  34.43 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.14 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.82 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.14 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.82 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.82 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.14 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.06 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.5 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  31.82 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.91 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.54 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.91 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.91 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3388  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.06 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.93 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  33.61 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19550  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  35.29 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0837  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  33.61 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.1 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.77 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.77 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.77 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.77 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 
266 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.99 
 
 
268 aa  71.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  27.01 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.93 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.63 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.34 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  26.63 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.43 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  26.87 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.24 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.06 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17880  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  33.33 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.615091  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.06 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.06 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.22 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.37 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.25 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2429  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.391574 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  35.64 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  25.99 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.88 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000456035  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.5 
 
 
292 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3978  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00187399  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3903  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  25.94 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.96153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.62 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.21 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.41 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.13 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0470076  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.14 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3555  NAD(P)H dehydrogenase protein  32.84 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4017  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  25.94 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117199  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.08 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.4 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  22.46 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1476  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.17 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  28.92 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154354  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.04 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  27.69 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.24 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  32.61 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2368  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.31 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.03 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.7 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.64 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1711  quinone reductase  27.1 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.92 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  26.24 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.64 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0353  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.64 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.64 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.64 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>