45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1596 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  633  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  31.67 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  32.47 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  32.35 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  29.39 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  31.33 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  28.29 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  29.76 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  27.44 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  28.14 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  32.58 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  35.54 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  37.29 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  34.71 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  39.32 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  37.82 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  31.33 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  32.52 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  55 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  38.33 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  34.78 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  40 
 
 		 1244 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  40.48 
 
 		 221 aa  50.4  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  43.9 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  43.59 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  47.92 
 
 		 1144 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  47.92 
 
 		 1163 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  40.48 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  45.71 
 
 		 635 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  48.57 
 
 		 1139 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  40.54 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_002978  WD0713  hypothetical protein  43.24 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  40 
 
 		 707 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  21.68 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  45.71 
 
 		 501 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  40 
 
 		 694 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2048  MJ0042 family finger-like protein  42.5 
 
 		 532 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2118  MJ0042 family finger-like protein  42.5 
 
 		 530 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000277169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  48.39 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  40.91 
 
 		 538 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  47.22 
 
 		 571 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  40 
 
 		 560 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  34.38 
 
 		 383 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>