49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0773 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 289 aa  579  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1806  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.31 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4301  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3653  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2840  hypothetical protein  31.45 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2527  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.59 
 
 		 230 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2493  hypothetical protein  31.88 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  28.42 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  26.32 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  26.78 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  28.1 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1059  hypothetical protein  38.02 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.292491  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  36.89 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  36.43 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  30.19 
 
 		 147 aa  48.9  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  28.32 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  31.03 
 
 		 142 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  27 
 
 		 145 aa  46.6  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 135 aa  46.6  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 		 140 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.69 
 
 		 1868 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.34 
 
 		 134 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2743  hypothetical protein  32.06 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4376  hypothetical protein  26.34 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  26.98 
 
 		 128 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  30 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  32.73 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  29.66 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.34 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2043  methylmalonyl-CoA epimerase  29.46 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  33.03 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  30 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  26.47 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4349  hypothetical protein  27.34 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1949  methylmalonyl-CoA epimerase  32.14 
 
 		 157 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.331779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4435  hypothetical protein  27.34 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.250893  normal  0.139367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  31.73 
 
 		 146 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2869  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.14 
 
 		 134 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15489  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2590  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 		 134 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.223231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1733  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 		 134 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 		 134 aa  43.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  27.81 
 
 		 139 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4545  methylmalonyl-CoA epimerase  32.14 
 
 		 134 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0847692  normal  0.36006 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  27.72 
 
 		 135 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  28.79 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0368  methylmalonyl-CoA epimerase  32.46 
 
 		 134 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  0.892682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>