More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1212 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1212  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
335 aa  683    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0150  aminotransferase class I and II  73.13 
 
 
335 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.646284  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0159  aminotransferase, class I and II  68.56 
 
 
337 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0133  histidinol phosphate aminotransferase  67.46 
 
 
357 aa  485  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  41.54 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.62 
 
 
358 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  28.48 
 
 
351 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  29.61 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
382 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  28.23 
 
 
382 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  28.23 
 
 
382 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
355 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  27.57 
 
 
356 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
351 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  29.23 
 
 
370 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  28.01 
 
 
357 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  28.32 
 
 
348 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  28.1 
 
 
353 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  27.82 
 
 
349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  29.01 
 
 
351 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  27.95 
 
 
360 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  28.83 
 
 
356 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  27.12 
 
 
357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  27.71 
 
 
357 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  27.87 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  27.46 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  29.08 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  29.29 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  29.29 
 
 
356 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  29.29 
 
 
356 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  27.99 
 
 
371 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  29.29 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  27.46 
 
 
359 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  28.27 
 
 
356 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  28.38 
 
 
356 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  27.06 
 
 
359 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  27.06 
 
 
359 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  27.06 
 
 
359 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  28.78 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  28.78 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  27.1 
 
 
350 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  27.06 
 
 
359 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  29.18 
 
 
366 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  27.68 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  26.5 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  27.71 
 
 
356 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
355 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  27.13 
 
 
371 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  27.89 
 
 
374 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  28.16 
 
 
357 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  26.54 
 
 
360 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 
368 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  28.12 
 
 
360 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  27.56 
 
 
365 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  28.39 
 
 
365 aa  103  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  27.08 
 
 
357 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  27.8 
 
 
348 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0188  histidinol phosphate aminotransferase  24.22 
 
 
369 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  27.43 
 
 
377 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  28.09 
 
 
369 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
402 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  27.91 
 
 
364 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  29.04 
 
 
373 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  25.08 
 
 
365 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
352 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  25.89 
 
 
360 aa  100  4e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  25.61 
 
 
356 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02041  aminotransferases class-I  24.53 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0980416  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  28.03 
 
 
406 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  24.7 
 
 
356 aa  99.4  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  33.47 
 
 
335 aa  99.4  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  29.35 
 
 
363 aa  99.4  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  28.03 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02041  aminotransferase class-I  24.18 
 
 
376 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  30.83 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  27.56 
 
 
364 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  26.11 
 
 
349 aa  99  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  26.59 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  26.59 
 
 
365 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  27.33 
 
 
354 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  25.4 
 
 
370 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  26.99 
 
 
346 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  25.58 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000204735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  27.43 
 
 
401 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0268  histidinol-phosphate aminotransferase  25.44 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  27.27 
 
 
351 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  26.28 
 
 
364 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  26.47 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  26.2 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1710  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 
335 aa  96.3  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 
346 aa  96.3  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2525  histidinol-phosphate aminotransferase  26.67 
 
 
358 aa  96.3  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.017315  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  27.34 
 
 
371 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0362  histidinol-phosphate aminotransferase  25.69 
 
 
364 aa  96.3  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  27.02 
 
 
391 aa  95.9  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>