More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0133 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0133  histidinol phosphate aminotransferase  100 
 
 
357 aa  717    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0159  aminotransferase, class I and II  72.92 
 
 
337 aa  494  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0150  aminotransferase class I and II  69.85 
 
 
335 aa  487  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.646284  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1212  aminotransferase, class I and II  67.46 
 
 
335 aa  485  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  45.05 
 
 
353 aa  276  3e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  28.16 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  29.83 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 
371 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  30.2 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  29.39 
 
 
356 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.48 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  27.49 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  30.21 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  27.7 
 
 
349 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  27.96 
 
 
358 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  30.55 
 
 
382 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  30.55 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  31.25 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  30.55 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  27.95 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  29.05 
 
 
351 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 
360 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  28.22 
 
 
359 aa  119  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  27.61 
 
 
357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  29.55 
 
 
373 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  28 
 
 
360 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  31.42 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  29.71 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  31.46 
 
 
365 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  31.33 
 
 
360 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
359 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
359 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
359 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  26.94 
 
 
368 aa  112  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  29.35 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  28.8 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  29.35 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  29.35 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  30.28 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  29.55 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  29.25 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  31.95 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  27.44 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  27.44 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  27.44 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  26.73 
 
 
357 aa  110  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  26.46 
 
 
356 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  28.75 
 
 
356 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  28.01 
 
 
368 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  24.39 
 
 
350 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  25.32 
 
 
368 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  27.16 
 
 
363 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  25.74 
 
 
356 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  27.16 
 
 
377 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  25.98 
 
 
355 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  28.82 
 
 
362 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  30.3 
 
 
356 aa  105  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  27.33 
 
 
364 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 
373 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  25.71 
 
 
357 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  29.89 
 
 
363 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
370 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  24.65 
 
 
371 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  31.31 
 
 
365 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
358 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 
354 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  26.83 
 
 
401 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  31.31 
 
 
365 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  26.75 
 
 
371 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  28.14 
 
 
362 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
357 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  26.97 
 
 
364 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  26.38 
 
 
348 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  27.55 
 
 
360 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  29.35 
 
 
365 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  24.84 
 
 
365 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  26.5 
 
 
371 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  33.79 
 
 
363 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 
369 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  28.75 
 
 
366 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1710  histidinol-phosphate aminotransferase  29.5 
 
 
335 aa  102  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
358 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
375 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  32.45 
 
 
335 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  35 
 
 
364 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  24.92 
 
 
371 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  26.35 
 
 
371 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  29.11 
 
 
366 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  29.64 
 
 
383 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  26.34 
 
 
350 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
366 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  25.32 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  29.93 
 
 
356 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  28.08 
 
 
391 aa  99.4  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  25.16 
 
 
354 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  23.93 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>