More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0530 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  77.88 
 
 
217 aa  314  6e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  72.22 
 
 
217 aa  314  8e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  75.12 
 
 
217 aa  307  8e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  42.03 
 
 
226 aa  160  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  42.6 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  39.27 
 
 
224 aa  142  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  40 
 
 
227 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  36.16 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  37.68 
 
 
234 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  35.38 
 
 
236 aa  116  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  33.48 
 
 
223 aa  115  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  33.14 
 
 
232 aa  111  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  36 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  34.51 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  34.07 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  33.48 
 
 
230 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  37.7 
 
 
235 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  34.96 
 
 
225 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  34.26 
 
 
234 aa  102  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  34.07 
 
 
225 aa  99  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  32.73 
 
 
225 aa  99  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  34.38 
 
 
241 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  31.05 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  35.03 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  34.27 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  27.51 
 
 
231 aa  92  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  32.84 
 
 
239 aa  91.3  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  32.95 
 
 
241 aa  88.6  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  30.3 
 
 
238 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  28.39 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  30.81 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  30.3 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  28.57 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf053  uridylate kinase  28.93 
 
 
240 aa  79  0.00000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  27.54 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  30.71 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  30 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  30.35 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  30.61 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  32.86 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  30.15 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  30.15 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  30.88 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  29 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  24.22 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  28.27 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  27.31 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  32.18 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  32.18 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  31.84 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  28.63 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  29.7 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  28.33 
 
 
237 aa  72  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  28.63 
 
 
244 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  27.8 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  27.78 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  28.03 
 
 
235 aa  72  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  27.92 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  27.92 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  29.41 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  29.21 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  29.21 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  29.29 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  25.21 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  32.47 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  28.45 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  29.24 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  31.5 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  31.07 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  27.92 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  28.03 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  29.24 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  27.92 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  29.05 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  28.57 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  27.47 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  30.65 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  30 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  30.5 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  28.57 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  25 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  30.88 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  29.15 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  28.39 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  29.56 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  26.73 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  26.73 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  26.73 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  25.96 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  29.02 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  30.39 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  24.59 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  28.91 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  27.45 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  28.75 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  28.81 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  26.15 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  26.26 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  27.94 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>