More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0179 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0179  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.631279  normal  0.975084 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0336  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  85.51 
 
 
218 aa  378  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.246929  decreased coverage  0.00542605 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1221  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  60.37 
 
 
218 aa  252  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.21617  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1440  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  56.62 
 
 
215 aa  240  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.294168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1227  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.86 
 
 
213 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000574756  normal  0.766781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1843  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.43 
 
 
451 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.572708  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2306  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.18 
 
 
351 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.500417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0704  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.55 
 
 
519 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0853  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.23 
 
 
246 aa  99  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0115  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.85 
 
 
244 aa  99  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.74 
 
 
262 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1942  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  32.44 
 
 
331 aa  98.2  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1787  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.58 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0142  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.91 
 
 
462 aa  95.9  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00937998  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.69 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.85 
 
 
478 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1293  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.42 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.4 
 
 
269 aa  93.2  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0608  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.87 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807775  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.97 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  36 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.26 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.02 
 
 
250 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.31 
 
 
491 aa  92.8  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1899  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.22 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.36 
 
 
462 aa  92.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  37.14 
 
 
464 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  37.14 
 
 
464 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.4 
 
 
261 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.71 
 
 
256 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.41 
 
 
464 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1713  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.2 
 
 
248 aa  92  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.116043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  38.57 
 
 
465 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19041  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.43 
 
 
267 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.166851  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0050  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  29.09 
 
 
467 aa  91.7  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.929104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.53 
 
 
528 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.9 
 
 
282 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.31 
 
 
481 aa  91.7  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.04 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.62 
 
 
463 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.62 
 
 
463 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3091  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.8 
 
 
263 aa  90.9  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000546581  normal  0.020085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.62 
 
 
463 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.11 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.41 
 
 
464 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2654  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.41 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.07 
 
 
503 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1505  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.5 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1761  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.21 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4641  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.41 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.08 
 
 
503 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.85 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.98 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.46 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.71 
 
 
464 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  36.11 
 
 
474 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2619  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.48 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923758  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.16 
 
 
490 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.16 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2286  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.41 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.53 
 
 
458 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.7 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.511728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2337  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.41 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1379  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.85 
 
 
478 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15345  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.55 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.56 
 
 
470 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1706  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.04 
 
 
297 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0211  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.98 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.283358 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.9 
 
 
511 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.93 
 
 
554 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2922  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.53 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.215743  normal  0.0409844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2610  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.12 
 
 
265 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0897375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.14 
 
 
462 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.68 
 
 
521 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.85 
 
 
253 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  37.86 
 
 
465 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.28 
 
 
487 aa  89  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18271  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.84 
 
 
261 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.74 
 
 
283 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
503 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35 
 
 
479 aa  89  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2762  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.03 
 
 
476 aa  89  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  35.26 
 
 
240 aa  88.6  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18851  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.48 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.5 
 
 
482 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.58 
 
 
478 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  32.9 
 
 
329 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1988  uroporphyrinogen-III methylase SirB, putative  31.75 
 
 
311 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.24 
 
 
476 aa  88.2  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  35.56 
 
 
279 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.19 
 
 
246 aa  88.2  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
478 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.4 
 
 
257 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1399  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.12 
 
 
478 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2422  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.43 
 
 
325 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.31 
 
 
478 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>