More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0520 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0520  pirin domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  44.07 
 
 
236 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  46.26 
 
 
234 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  50.26 
 
 
232 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  49.74 
 
 
232 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  50.77 
 
 
232 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  45.66 
 
 
232 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  49.74 
 
 
232 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  49.74 
 
 
232 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  49.74 
 
 
232 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  49.24 
 
 
232 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  49.74 
 
 
232 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27889  predicted protein  44.83 
 
 
234 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.731837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  45.21 
 
 
232 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  44.75 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  40.55 
 
 
235 aa  165  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  38.36 
 
 
232 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  37.9 
 
 
232 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  40.65 
 
 
232 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  38.81 
 
 
236 aa  154  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  37.44 
 
 
236 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  39.73 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  38.79 
 
 
232 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  40.53 
 
 
235 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
235 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  36.99 
 
 
232 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  36.71 
 
 
238 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  38.36 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  38.36 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  40.22 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  37.9 
 
 
241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  39.13 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  36.99 
 
 
241 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  36.99 
 
 
241 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  36.99 
 
 
241 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  36.86 
 
 
233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  41.53 
 
 
233 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  37.14 
 
 
233 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  37.56 
 
 
232 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  37.93 
 
 
232 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  37.44 
 
 
241 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  37.56 
 
 
236 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09076  possible Pirin family protein  36.6 
 
 
238 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  37.56 
 
 
236 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  37.44 
 
 
241 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  37.25 
 
 
232 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  36.92 
 
 
233 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  36.53 
 
 
242 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  38.07 
 
 
233 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  36.1 
 
 
232 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  37.44 
 
 
241 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  36.71 
 
 
235 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5011  Pirin domain protein  36.25 
 
 
239 aa  141  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  40.86 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  33.94 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  36.87 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  36.53 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  35.53 
 
 
233 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  36.9 
 
 
233 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1220  pirin domain-containing protein  36.45 
 
 
231 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.110776  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1291  pirin domain-containing protein  36.45 
 
 
231 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3182  Pirin domain protein  37.79 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1221  pirin domain-containing protein  36.45 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  38.25 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1808  Pirin-like  37.44 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  35.05 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  36.86 
 
 
253 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  35.87 
 
 
233 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  42.02 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  42.02 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  42.02 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0380  Pirin domain protein  41.45 
 
 
236 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.489995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  34.11 
 
 
236 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1735  pirin domain-containing protein  35.35 
 
 
238 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  38.69 
 
 
232 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  40.43 
 
 
241 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1390  hypothetical protein  40 
 
 
231 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0092148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  38.04 
 
 
232 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  37.56 
 
 
233 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5473  Pirin domain protein  36.99 
 
 
239 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1696  hypothetical protein  36.19 
 
 
246 aa  135  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.578384  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  37.44 
 
 
232 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1676  Pirin-like  37.98 
 
 
231 aa  135  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.192961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  38.76 
 
 
239 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  37.16 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0621  pirin domain-containing protein  39.18 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000898789  normal  0.199637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  35.92 
 
 
356 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0356  Pirin domain protein  37.62 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00920786  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  35.32 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  36.87 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1827  Pirin domain protein  37.89 
 
 
232 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0905594  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  38.33 
 
 
231 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  35.94 
 
 
233 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0103  Pirin-like  34.98 
 
 
245 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  35.02 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  37.62 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2998  pirin domain-containing protein  34.86 
 
 
236 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1833  Pirin-like protein  34.76 
 
 
255 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.441024  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  36.89 
 
 
231 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  36.87 
 
 
240 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>