36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2776 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  55.22 
 
 		 832 aa  944    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  100 
 
 		 838 aa  1743    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  58.86 
 
 		 627 aa  790    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  27.29 
 
 		 722 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  26.68 
 
 		 801 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  26.59 
 
 		 965 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  27.82 
 
 		 839 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  25.29 
 
 		 951 aa  172  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  26.92 
 
 		 580 aa  138  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  24.34 
 
 		 1011 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  24.43 
 
 		 648 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  22.27 
 
 		 2286 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.42 
 
 		 789 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  23.42 
 
 		 788 aa  101  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  22.34 
 
 		 677 aa  97.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  23.2 
 
 		 563 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  22.83 
 
 		 791 aa  91.3  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1121 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  25.52 
 
 		 689 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  24.66 
 
 		 1049 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  22.85 
 
 		 752 aa  74.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  23.28 
 
 		 709 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  26.92 
 
 		 112 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  29.81 
 
 		 109 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  29.81 
 
 		 110 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  25.55 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  22.96 
 
 		 708 aa  58.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.3 
 
 		 644 aa  55.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1024 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  28.85 
 
 		 110 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  26.73 
 
 		 119 aa  47.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2936  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1022 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.897534 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  25.7 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  20.97 
 
 		 679 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  24.75 
 
 		 108 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4588  hypothetical protein  26.88 
 
 		 692 aa  44.3  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>