31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5741 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  100 
 
 		 109 aa  229  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  70.64 
 
 		 110 aa  173  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  71.03 
 
 		 108 aa  159  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  64.22 
 
 		 110 aa  157  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  63.89 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  51.85 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  48.15 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  45.37 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  45.37 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  43.64 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  48.15 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  43.12 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  42.59 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  41.67 
 
 		 112 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  41.67 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  43.27 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  38.83 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  38.83 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  38.83 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  39.13 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  29.81 
 
 		 838 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  32.73 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  33.67 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  37.11 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  25.47 
 
 		 832 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  31.19 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  30.85 
 
 		 367 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  29.47 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>