25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3138 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  233  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  62.5 
 
 		 113 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  63.3 
 
 		 109 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  64.22 
 
 		 109 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  57.14 
 
 		 113 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  55.75 
 
 		 113 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  56.76 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  58.04 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  56.25 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  55.36 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  50 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  53.77 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  53.77 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  53.77 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  48.15 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  45.45 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  48.62 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  40.74 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  41.82 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  44.34 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  37.72 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  38.78 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  37.97 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00650  hypothetical protein  38.81 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  25 
 
 		 838 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>