25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6338 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  226  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  74.31 
 
 
113 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  70.64 
 
 
113 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  69.72 
 
 
113 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  67.89 
 
 
109 aa  164  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  66.06 
 
 
112 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  64.22 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  63.3 
 
 
113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  63.3 
 
 
112 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  54.63 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  48.15 
 
 
110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  61.17 
 
 
106 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  61.17 
 
 
106 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  61.17 
 
 
106 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  49.07 
 
 
110 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  49.09 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  50 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  45.37 
 
 
109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  47.71 
 
 
108 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  42.86 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  38.74 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  40 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  38.71 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01009  DUF718 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12860)  33.8 
 
 
114 aa  42  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0197794  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0801  protein of unknown function DUF718  32.32 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.771693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>